Resultatet betyr at en regjeringskrise avverges og at statsminister Erna Solberg kan bli sittende.
I tillegg ventes nå KRFs partileder Knut Arild Hareide å forlate sin stilling.
Uavgjort stemme
98 delegater stemte for at KRF skal gå inn i regjeringen sammen med Høyre, Venstre og Fremskrittspartiet.
90 delegater stemte for at KRF i stedet skulle ta et skritt til venstre og begynne å samarbeide med Arbeiderpartiet og Senterpartiet og dermed inngå i en venstre-sentrum-koalisjon, noe som hadde skapt regjeringskrise.
2 personer stemte blankt.
– Det har vært ekstremt jevnt, sier Marie Nordstrand, SVTs utenriksreporter på plass i Oslo.
Hun konstaterer at regjeringskrisen i Norge er avverget og at statsminister Erna Solbergs posisjon nå er styrket.
– Hun har lenge ønsket å ha KRF i en borgerlig regjering og det får hun nok nå.
Statsvitere sammenligner med C + SD
Statsviteren Svein Erik Tuastad, som jobber ved Universitetet i Stavanger, slår fast at avstemningen er en seier på kort sikt, men at KRF risikerer å bli upopulær på lengre sikt.
Og han forventer bråk dersom KRF settes i samme regjering som det populistiske Fremskrittspartiet.
– Det er som om C skulle sitte i samme regjering som SD i Sverige. Det blir mye trøbbel i politikken fremover, sier han.
KRF har svak oppslutning
Siden 2013, da det ble et støtteparti for regjeringen, har KRF tapt stadig flere stemmer. Ifølge NRKs siste meningsmåling har partiet tre prosent.